医学影像高性能计算解决方案

  生物信息学（Bioinformatics）是在生命科学的研究中，以计算机为工具对生物信息进行储存、检索和分析的科学。其研究重点主要体现在基因组学（Genomics）和蛋白质组学（Proteomics）两方面，具体说就是从核酸和蛋白质序列出发，分析序列中表达的结构功能的生物信息。

主要应用软件为：
 BARRACUDA,CUDASW++,CUSHAW,NVBIO,NVBowtie,PEANUT,REANUT,REACTA,SeqNFind,SOAP3,UGENE,WIDELM,及Materials Studio等　

实子集群高性能计算解决方案　

1.采用四路E5-4600V2系列（主频高于2.5GHZ）4U超算平台，其适用于分子动力学应用，实现大规模并行

2.搭配采用GPU计算平台，NVIDIA TESLA K80/K40系列高性能计算卡，单机能容纳4个GPU卡，CUDA核心数能达到19968核心

3.存储系统采用，多台72盘位大容量存储，单机容量达到288T;因为I/O压力比较大，因此存储读写性能要求快；同时数据量非常大

4.集群计算网络采用Infiniband FDR(56GB),管理网络采用万兆网络

5.管理及其应用软件，根据用户需求安装系统及搭建使用环境,软件环境包括基于Linux核心开发的操作及管理系统,提供MPI并行环境的搭建，GCC系列编译器,C,C++,fortran,java 等，并优化科学计算库BLAS/ATLAS/Lapack/ScalaPack/FFTW等以及源代码开放的计算与模拟软件等，高级工程师优化PBS作业管理与作业调度系统，依据用户的要求编写相关脚本。

6.实子集群所有节点采用80PLUS高效（96%）电源，提高电源转换效率，降低用户运维成本。结合集群管理监控软件，自动将空闲资源设置为待机或者关机状态，整体节能降低20%

      实子集群结合用户实际应用需求，帮助用户解决其应用难题，节约科研经费。